Razpizdljen!

Kej takega pa že dolgo ne... Dns sm pršu u službo samo zato da si prpravim vzorce in jih popoldne pogledam in poslikam... Jok brate... Odprem inkubator in vržem vn oči... Komorca s celicami obrnjena na glavo. Celice so šle normalno v plavalno društvo, tko da nism mogu z njimi neč druzga ku vržt u koš... Grrr. Najbolj pa razpizdi dejstvo, da je nekdo to prevrnu in neč zinu, vsaj poklicu bi lahko in reku da je zvrnu. In bi dal takoj na prow in bi blo vse OK, tko pa dns pač gledam u luft namesto v mikroskop... Glede na to, da je bla včeri fešta ne vem kej je bujši. Upam samo da ni kdo namenoma sabotiru eksperimenta, k pole če ga dobim v roke bo kažin! In kot bi reku poleti, sigurno so IGEM-ovci krivi (hec, v bistvu so oni še anjbolj pridno pospravljali, k so se vseh mal bali). Zdej mi pa ne preostane druzga ku it nacepit nove celice, da čimprej ponovim zadevo.

Gensko spremenjeno

Prav zanimivo je videti kako je nedavni dokumentarec o Monsantu sprožil ponovno gonjo proti gensko spremenjeni hrani po blogih raznih wannabe opinion makerjev. Sej se tud jst ne strinjam s politiko Monsanta in zapatentiranjem življenja, ma hkrati kot biokemik vidim prihodnost ravno v gensko spremenjenih organizmih, pa naj bo to za hrano, obleko, gradbeni material ali zdravila. Ta bi brez gensko spremenjenih organizmov tako ali tako brez veze, ker bi bila njihova priprava astronomsko predraga. Gensko spremenjeni gradbeni materiali, si boste mislil kaj k. je zdaj to? Pajkova svila je na enoto mase močnejša od jekla, če bi jo uspeli nagojiti v večjih količinah bi lahko z manjšimi spremembami v arhitekturi postavljali prav neverjetne zgrabe. Ravno tako bi se vlakna z izboljšanimi lastnostmi uporabila v tekstilni industriji. Si predstavljate pulover, ki se ne umaže, se ne raztrga, se prilagodi zunanji temperaturi, ob vsem tem je pa 100% biorazgradljiv? Pa da gremo na glavno področje, gensko spremenjeno hrano. Kako bo človeštvo preživelo, ko ne bomo mogli več pridelat dovolj hrane na konvencionalen način? Kako bodo ljudje, ki si bodo prisiljeni pridelovati hrano na revni, izkoriščeni zemlji lahko pridlali dovolj raznolike zelenjave za pokritje potreb po vseh vitaminih, ki jih drugače ne moremo dobiti? Zato mislim da je v genskem spreminjanju še velika prihodnost, pod pogojem da je biotehnološki del narejen varno in premišljeno. Ker koruza ki jo škropimo z tonami strupenih snovi zagotovo ni zdrava. Kaj pa koruza ki je ni potrebno škropiti? To je pomembna razlika med gensko spremenjenim in gensko spremenejenim.

Igem 2008

Torej, slovenija se je kot ponavadi uvrstila v finale...

In z malo zlobe in veliko ponosa bi lahko rekli, da je ku ponavadi pobrala prvo mesto v svoji skupini. In ku da že to nebi bil zadosti velik uspeh, je letos Ljubljanska ekipa pobrala skupno prvo mesto in stekleno BioKocko, lih tko za spomin in za ložt u vitrinu...
Bravo vsem skupej, glede na pregarane ure v labu ste si res zaslužli...
Al pa ste se tko ustrašli Mojce, k je rekla da brez kocke ne niti hodit nazaj :D

Prevec delam

Danes mi je nekdo napisal nej ne tolko delam, ker mečem slabo luč na ostale MRje...
Mislim da če 1 tedn malo streljam in delam po 9 ali 10 ur na dan sm še kar daleč od tega da bi metal slabo luč na ostale MRje, tko da nč bat, MRji ki berete moj blog, ne bom vas osenčil...
Je pa res da se mi od vsega tega dela in inkubiranja in kloniranja in rezanja in flikanja že kr malo fuzla u glavi... Zato pa pada tak zmeden post na blog. Sm ugotovu da nimam več kondicije za bit po 9 ur u labu, proti koncu kar fajn pade koncentracija. Si morem zjutrej vse napisat in pole samo delat kljukice, kr čene sigurno kej pozabim. Tko da me prosim spomnte če veste da sm danes kej pozabu...
Še dobro da je jutri petek :D

Back again

Delo Grčija Delo "Beach Volley" Žuri

Mislim da so to glavni razlogi zakaj že ogromno časa nisem nič napisal. In ne, delo se ne naključno ponovi 2x.
K sreči so zadnje cajte začeli moji eksperimenti prihajati h sebi in dajati vsaj malo zananstveno zanimive rezultate. To pa jasno pomeni samo še več dela, ker so tej rezultati znanstveno zanimivi, vendar drugačni od pričakovanih rezultatov. Zakaj?
To moram še ugotovit. Tako da sem že pripravljen na novo fazo kloniranja, rezanja in limanja DNA v naši Hi-Tech kuhinji.

Vmes sem pa bil na dopustu v Grčiji... Bilo je krasno, malo pohajanja po jonskih otokih in izlet do samostanov Meteora.

A kdo ve zakej se začnejo razultati pojavljat lih preden maš za it na dopust? ker zdej sm spet rabu skor ceu tedn da sem lahko začel razmišljat o delu in o eksperimentih...
No, sej ni tako slabo, sm že skloniral prve konstrukte, zdej morem obem še nekej obesit in to je to...
Pole pa gremo spet mikroskopirat, wiii

Sveti? Sveti!

Končno
Lahko se pohvalim da mi je uspelo prepričat moje GFP konstrukte, d so začeli delovat tko kot je blo predvideno... Zdej pa samo še tadologočasen del...optimizacija. Pol pa upam da bom odkril kašno novo zanimivo dimerizacijo... :D

2 down, 1 to go

Uf, izpit je mimo! Spet morem rečt nekej čez profesorja, o katerem sem že pisal, ker je za svoj del izpita prispeval konfuzno zmedena vprašanja. Za ta izpit sm bil prisiljen naredit nekej, kar nisem že zeloo dolgo časa (mogoče sploh nikoli). V soboto in v nedeljo sem se učil do poznih večernih ur. Predvsem me skrbi tudi to da nisem šel ne v petek ne v soboto nikamor pohajat. Grozno, v kej vse je človek prsiljen, ko je enkrat v službi in more ob delu še en izpit naštudirat. Drgač pa pohvala ostalim dvem profesorjem, k sta prpravlja taka vprašanja, da sm čisto sam kriv, če nisem dovolj dobro snovi naštudiral. Ne pretežka in ne prelahka, pa z spodbujanjem razmišljanja. Tretji je pa spodbujal predvsem domišjijo... :(

Happy Birthday

Slucajno berem knjigo o zgodovini DNA in kaj odkrijem....
Na današnji dan mineva natanko 55 let od odkritja 3D strukture (zloglasne dvojne vijačnice) DNA

Jst se ne grem več!

Aaaaa
Že res da sem študent na podiplomskem nivoju in da morem znat sam poiskat informacije ki jih rabim za delo/študij. (sej nekej dejansko znam).
Vseno pa mislim da bi se mogli naši mentorji mal boj potrudit in mal bolj koherentno predavat, na samo filat slajde na zaslon, nekej malega povedat zravn, malo vrtet sliko od enga proteina in to je to... Zgleda skor tko, ku da full ve in bi nam rad posredoval svoje znanje, ma ga enostavno ne zna posredovat.
Da ne govorimo o člankih... prvič; Do polovice ali več nimam dostopa, do enga od predpisanih nima noben dostopa oziroma če kdo ma dostop, potem članka noče posredovat naprej...
drugič; Profesor reče samo preberte to, na pa na kej nej se koncentriramo in u zvezi s čim nej teče diskusija, pol pa začneš spraševat nekej o metodah, pa te gleda ku da si z marsa in da bi mogu to vse že na dodiplomcu znat...
/me frustrated

Four components of food

fat, salt, sugar and fluorescence

Tole mi je javu moj fortune cookie widget. V mojem primeru je fluorescenca dejansko zaželjena, glede na to poskušam sestavt sistem za detekcijo dimerizacije s komplementacijo fluorescence (kratica: BIFC). Tko da držte pesti da bo kej svetlo...

Izpit je mimo!

Ma ku je doro met po dolgem cajtu malo prostega časa...
Projekt Brlog se je končno spet premaknu z mrtve točke, malo sm krame pospravljau (nikoli ne bo zares pospravljeno :( ), pa še celo pustne maske smo lahko izdelovali. Smo se odločli da bomo pikapolonice... To bo še smeh :)
V glavnem ugotovu sem da je moj vrtalni stroj prevelik, zato je blo treba vrtat luknje z zunanje strani omarice (ki ji je namenjeno da bo postala brlog). Ceu projekt je naciljat vrtalni stroj samo z metrom in kotnikom tko da prideš točno na črto, ki je narisana znotraj omare...Vizualno ciljanje je dosti lažje, zdej razumem zakaj hočejo met Američani čelado ki usmerja streljanje tja kamr gledaš... Ma vseno mi je ratalo, tko da morem samo še vrata naredit, pa bo prva faza končana! Pol pa gas z notranjo opremo? A podgane majo tudi rade Feng-Šui?
Še malo o delu. Zgleda da mi je uspelo po blotu detektirat TLR4, čeprov še sam ne verjamem po tolk neuspelih poskusih. Morem ponovit, da se prepričam...Notranji glas mi pravi NEEE, NE TEGA DELAT! BOŠ VIDU DA DVAKRAT NE RATA!...Ma tku je, je treba met znanstevno ponovljiv eksperiment, zato bom to v vsakem primeru mogu naredit. Sm optimist im mislim da zdej sm nagrunt kej je treba narest...Aja sm pozabu oment...Rezultati izpita so že! NAREDU!
Oceno pustmo stat, k nism zadovoljn...

Nesreca nikoli ne pociva

Kr ma hudič mlade, jih ma več...in vsi so po karakterju podobni gospodu Murphyju!
Danes sem imel svoj prvi izpit na podiplomskem študiju. Porazno! Pa ne z moje strani, jst sm se korektno pripravu na izpit. Vprašanja so bila na obkrožanje, 5 podanih odgovorov, 1 ali več pravilnih. Če ne štejemo, da so se pri vprašanjih in odgovorih pojavljale tipkarske napake na življenjsko pomembnih mestih (ekvivalent prvi bazi kodona :D), tako da nisem vedel ali je tipkarska napaka ali napačen odgovor. Potem so bila tu dvolično postavlejna vprašanja, ko je bilo število pravilnih odgovorov odvisno samo od tega, kako močno si se poglobil v omenjeno metabolno pot. Tko da smo s kolegi spisali eno pritožbico, pa upamo da se bomo sestali s profesorji in kej rešli.
Poleg tega se mi je zgodila še telefonska nesreča, in to ne tiste vrste da bi kdo najdu prepovedane klice in SMSe notri, ampak mi je telefon padu u vodo, k sreči je prej izpadla baterija (od šoka :D), tko da upam, da ko se posuši bo še vedno deloval. To je zazdej to...Preventivo sem se odloču da danes ne grem nikamr vn, ampak ostanem doma. Saj veste, največ nesreč se zgodi v oddaljenosti manj kot kilometer od doma, tko da se morem preselit! V bistvu lovim še kašno nesrečko...eno mičkino, lih za pred spanjem!

I LOVE my job...sometimes

Mislim da se tale blog pomika vedno bolj v smer biokemije in molekularne biologije, raziskovanja na KI in nasplošno Life Science področja. Ker zadnje cajte ne utegnem mislit na skoraj nič drugega kot to.
Ker mi neka mutacija noče uspet s Quikchange protokolom, uspela pa mi je na drugem plazmidu smo se odločili, da z metodami rekombinantne DNA (kolk se to učeno sliši) spravimo mutacijo v drug plazmid...In zdej to delam... upam da vsaj zdej bo ratalo, kr če ne bo joj! Uglaunem, bom poročal naslednji tedn, ko spravim vse koščke dna skupej in konstrukt v našo domačo žival, E.coli.
Upam da na ta način mi bo uspelo, čeprav sem ugotovil, da nimam sreče z laboritorijskim delom, ker mi spodletijo najbolj osnovne stvari... Morem začet delat kaj bolj kompleksnega, lohko da mi bolj leži...Yeah, right!

Btw, fotoaparata mi še edno niso popravli, disk od PCja je začel magično nazaj delovat, podgane pa rastejo ku mataste, so že 2krat večje kot ko smo jih dobili. Pa tko simpatične rdeče očke majo...

Služba, Izpit, Seminarji,

zaradi zgoraj napisanih razlogov nekaj časa nisem nič pisal...Uhhh
Se morem malo razpisat na to temo.
Kot prva generacija Bolonjskega podiplomskega študija Biokemije imamo s kolegi in kolegicami letos nehvaležno nalogo, da smo poskusni zajčki. resnično upam da nam bo zaradi tega kej pogledano skozi prste na izpitu, ker nimamo nobenih informacij od prejšnjih generacij. Sploh bo zanimivo že to, da je izpit samo pisni, računalniško sestavljen iz baze vprašanj in računalniško obdelani rezultati. To bo še žur!
Kot da ni dovolj grozno že to, da niti približno ne vemo, kolko detajlno mora bit naše znanje na izpitu, imamo poleg tega še obvezne seminarje in obvezno pristnost na predavanjih...Profesorca nas kliče po seznamu, ku da bi bli v prvem razredu...pri dopolnilnem pouku! In na seminarjih moremo sodelovat z vprašanji in z razpravo, normalno da smo zato nagrajeni s plusi in minusi. V Redovalnico, kam pa drugam! Upam samo da bojo za prihodnje generacije to kej popravili, ker se študenti počutimo malo retardirano, in upam da se zaradi tega tko počuti še vsaj kdo od profesorjev, ker se bojim, da je tisti ki si je to zmislu brezupen primer!

Lep uvodnik v predstavitev mojega študija, ne?
da ne boste rekli da je vse tko črno, vam predstavim še par pozitivnih stvari. Učimo se zanimive stvari, ki nam jih predavajo profesorji, ki to dejansko raziskujejo, tako da znajo odgovorit na naše "Zakajčke". Kot prva genreacija smo se spriajznli s tem da smo poskusni zajčki in si poskušamo naredit življenje lažje s prilagajenjem programa in predlogi popravkov. pa še fajn klapa smo in se družimo tudi izven strogo šolskih dejavnosti.

Ker pa kot MR hodim tudi v službo, imam tudi na tem področju svoje zadolžitve. tako se zdej ukvarjam s pripravo "split" flourescentnega proteina, naštudiral pa naj bi še bakulovirusni ekspresijski sitem. To bo še žur...Upam da ne bom imel takih problemov kot z diplomo amapak kakšne drugačne...Lažje :D